ChemDraw 的使用方法（一）
ChemOffice作為有機化學(xué)常用的工具，包括在對于反應的進(jìn)程、反應機理、特定有機化合物的性質(zhì)（核磁氫譜、核磁碳譜、酸性、親水性等性質(zhì)）主要是由ChemDraw完成的。包括對于有機物空間結構的建立、特定簡(jiǎn)單力場(chǎng)下（分子動(dòng)力學(xué)、光譜信息[紫外光譜、拉曼光譜]的模擬、核磁氫譜的模擬、最低能量態(tài)的鍵搜尋（單鍵、雙鍵）等）主要是由Chem3D完成。包括對于已知有機化合物的搜尋、已知反應的檢索（特定檢索反應物、生成物、催化劑、溶劑體系等）主要是由ChemFind完成。本篇文章主要講述ChemDraw的使用方法（以ChemDraw 18.0為例），同時(shí)以在文獻中經(jīng)常出現的工作為例進(jìn)行重復。[10篇文章]
圖 1.ChemDraw的工作頁(yè)面
具體菜單欄就不進(jìn)行一一介紹了，直接開(kāi)始講應用。
· 應用一：反應的書(shū)寫(xiě)
事實(shí)上在每一篇涉及到有機合成的文章中，都會(huì )選擇使用ChemDraw。比如說(shuō)最近出來(lái)的一篇關(guān)于“2，3-取代基喹啉在膦-酰胺配體催化劑非對映和不對稱(chēng)選擇加氫”的文章中，對于反應式的書(shū)寫(xiě)如下：
圖 2.原文圖片（1）
可以看到，文章中的化學(xué)式有著(zhù)極好的整潔和對稱(chēng)，這就需要我們選擇調用view菜單下Show Crosshair（也可以直接選擇Ctrl+H），對于書(shū)寫(xiě)工整有著(zhù)極好的幫助：
圖 3.實(shí)際操作（1）
在這里有些同學(xué)會(huì )問(wèn)吡啶基怎么加的？或者R1、R2、R3是怎么加的？事實(shí)上這些操作都很簡(jiǎn)單，只需要找到功能欄的 “A” 符號（如圖 3所示），直接用輸入法輸入“雜原子（N、O、S等）、金屬原子等”即可，注：不可直接輸入取代基。
可能又有同學(xué)問(wèn)了，在這里化學(xué)式占整個(gè)紙張的比重非常大，存在寫(xiě)不開(kāi)的尷尬境地。這里就需要完成兩個(gè)操作（任選其一就行）：
（1）修改化學(xué)式的大?。ㄈ鐖D 4選中化學(xué)式，右鍵scale對比例進(jìn)行設置，再次修改比例會(huì )在原先修改的基礎上累加）
（2）修改紙張大?。ㄟx擇File下Document Setting，對Document Size進(jìn)行修改，即可修改紙張大?。?/p>
圖 4.實(shí)際操作（2）
圖 5.修改分子式大小
完成了上述準備階段，我們可以繼續書(shū)寫(xiě)方程式了。
圖 5.實(shí)際操作（3）
在寫(xiě)到反應條件時(shí)，可以看到，我們輸入[Ir(COD)Cl]2時(shí)會(huì )出現錯誤提示，只需要把View下Show Chemical Warning取消掉即可（值得說(shuō)一下，Show Chemical Warning針對反應式正視圖錯誤、文本錯誤可以進(jìn)行突出顯示，提醒修改）。
另一方面，針對于數字下標問(wèn)題，只需要對所選數字右擊鼠標，選擇Style下Subscript即可（快捷鍵F9），如果需要數字上標，只需要在Style下Superscript即可（快捷鍵F10），如果什么都不用只需要在中間，選擇Formula（快捷鍵Ctrl+F）。
除了上述兩個(gè)問(wèn)題，對于文本字號設置，也是對于美觀(guān)的一個(gè)重要體現，只需要選中文本，右鍵size下即可修改字號。
圖 6.實(shí)際操作（4）
對于橡皮的使用，可以擦掉雙鍵中的單鍵，如果需要整個(gè)分子刪除，可以選中整個(gè)分子，按下鍵盤(pán)上的“Delete”鍵即可。
圖 7.實(shí)際操作（5）
對于鍵顏色的選擇，可以選中化學(xué)鍵，直接在菜單欄color中找到自己喜歡的顏色即可。
圖 8.實(shí)際操作（6）
· 應用二：化合物性質(zhì)情況的描述
以上一次的催化劑為例，進(jìn)行對于（系統命名、性質(zhì)（親水性、酸性）、核磁氫譜、核磁碳譜的描述）
對于系統命名，我們需要選中整個(gè)分子，選擇Structure下Convert Structure to Name（快捷鍵Alt+Ctrl+N）。
圖 9.系統命名法
在對于其核磁信息進(jìn)行模擬的時(shí)候，我們仍然是在Structure下選擇H-NMR和C-NMR即可。
圖 10.核磁共振氫譜的模擬
圖 11.核磁共振碳譜的模擬
在這里需要注意一點(diǎn)：模擬的核磁共振氫譜和碳譜都只存在指導作用，不能代表實(shí)際情況，在不同條件下（Linux、Win系統）數據不同（已經(jīng)被證實(shí)）。
圖 12.相關(guān)參數的計算
選擇View下Show Chemical Properties Window，可以展示Pka、LogS等參數，對溶液有一定的作用。